Una de las cosas que la gente menos conoce es el tema de control de acceso de los usuarios , permisos etc. Os pongo el post sacado de esta URL .  https://technet.microsoft.com/library/fp161361.aspx

Todas las instancias de Project Web App pueden usar los modos de permisos de Project Server o SharePoint para controlar el acceso de los usuarios.

Project Server 2013 ofrece dos modos de seguridad para controlar el tipo de acceso de los usuarios a sitios y proyectos:

  • Modo de permisos de SharePoint   En este modo, que es una novedad de Project Server 2013, se crea un conjunto especial de grupos de seguridad de SharePoint asociados con Project Server 2013. Estos grupos se usan para garantizar a los usuarios distintos niveles de acceso a los proyectos y la funcionalidad de Project Server. El modo de permisos de SharePoint es nuevo para Project Server 2013.
  • Modo de permisos de Project Server   En este modo, Project Server ofrece un conjunto de grupos de seguridad personalizables y funcionalidad adicional diferente de la que se usa en los grupos de SharePoint. Se trata del mismo modo de seguridad que se encontraba disponible en Project Server 2010.

La tabla siguiente contiene las características disponibles en cada uno de los modos de seguridad.

Las nuevas instancias de Project Web App usan de forma predeterminada el modo de permisos de SharePoint. En una instalación local, el modo puede cambiarse para una instancia determinada de Project Web App con el cmdlet Set-SPProjectPermissionMode de Windows PowerShell. Para más información, vea Set-SPProjectPermissionMode.

Advertencia:
Al cambiar entre los modos de permisos de SharePoint y Project Server, se eliminan todas las configuraciones relacionadas con la seguridad. Si cambia del modo de permisos de SharePoint al clásico de Project Server, tendrá que configurar de forma manual la estructura de permisos de seguridad en Project Server 2013. Si realiza el cambio a la inversa, eliminará la información sobre permisos de seguridad de Project Server 2013.